https://calendar.app.google/jwAyFfBt2crc1SHo7
Toplantıyla ilgili beklentilerinizi paylaşır mısınız: https://forms.gle/qhQ7aGpdC6Pn7f1c9
#patoloji #patolog #istatistik #biyoistatistik #jamovi

Toplantı ile ilgili bazı ön bilgiler:
- Bir çalışmaya başlamadan önce, çalışma sırasında ve çalışma sonunda istatistik uzmanı ile görüşmek elzemdir.
- Kendi ön analizlerinizi yapabilirsiniz ama istatistik uzmanı olmadan yapılan çalışmalar hatalı olmaya mahkumdur.
- Veri analizlerinde zamanın %80'inin veri temizleme ile geçtiği söylenir. İstatistik uzmanları ile geçirilen zamanın verimli geçmesi için temiz veri hazırlamak lazım.
- Bu toplantıda biraz daha temel konuları konuşalım:
  - Temiz veri nedir?
  - Uzun ya da Geniş veri hazırlama.
  - Temel klinikopatolojik değişkenler için veri hazırlama.
  - Sağ kalım analizi için veri hazırlama.

Bazı beklentilere önden cevaplar:
- Veri girişi için örnek olarak bir spreadsheet (excel ve google sheets) kullanacağız.
- Skorlamaların analiz için nasıl kodlanacağına dair örnek konuşacağız.
- Patolog istatistikten ne kadar anlamalı ve patoloji çalışmasında olması gereken istatistik analizleri için belki daha sonra bir toplantı yaparız.
- Yeni tanımlanan immunhistokimyasal boyanın boyanma yüzdesi ve yoğunluğunun geçerli eşik değerini bulmak için sensitivite, spesifisite, ROC analizi, sağkalıma yönelik ROC analizi konuşmak lazım. Onlar belki çok sonra.
- Annotasyonlarda gözlemciler arasında uyuma bakmak için altınstandart varlığına göre bakmamız gerekenler değişebilir. Altın standart yoksa F1 test benzeri Dice Test kullanılabilir. Bu da bu toplantı için erken.
- Normalizasyon, veri transformasyonu gibi konular da şu an için erken.