Skolan har undervisningen en gång i veckan på onsdagskvällar. Skolan drivs av en föräldraförening och följer Skolverkets läroplan för kompletterande undervisning för svenska elever i utlandet och arbetar med svenska läromedel. Eleverna delas in i grupper beroende på ålder och språknivå.
Avgifter Svenska skolan i Tokyo: Grupp
Raketen (för de yngsta eleverna), Svenska Online, samt handledning för Sofia Distans och Hermods: ¥ 40 000/termin. Låg- och mellanstadium: Grupp Kometen️
samt Grupp Alien: ¥ 35 000/termin.