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RNAseq解析お見積もり・お問い合わせ
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micro@tani8020.jp
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解析作業内容
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RNA-seq（ショートリード）
メタトランスクリプトーム解析（細菌叢RNA）
Other:
Required
検体の種類・生物種名を教えてください
細菌・古細菌、昆虫、植物等の生物種名をご記入ください。
細菌叢解析であれば、由来する生物および検体の種類（ヒトの唾液検体、マウスの腸管内容物等）を教えてください。
研究内容保持のために記入できない場合は、不要です。
検体種類・生物種名
Your answer
検体数
Your answer
n数と群数について教えてください。例：n=3で2群の6検体
Your answer
RNA-seqの作業についてご希望をお知らせください。
PolyAによるｍRNAの精製の後、ランダムプライマーによる逆転写を行います。
Directionalのライブラリー調整を行います。
DNBSEQあるいはNovaSeq6000で150bp×２のシーケンスを行います。
一般的には５G(1700万リード）・６G(2000万リード）を読むことが多いです。
その他、必要な作業や、ご希望のキットがあればご指定ください。
RNA-seqが初めての方は、お気軽にご相談ください。
ご希望のシーケンサー
*
DNBSEQ
NovaSeq 6000
どちらでも良い
必要なデータ量・リード数（1検体あたり）
Your answer
検体の状態
*
未抽出の検体（感染性がないものに限る）
抽出済みRNA (total RNA) 500ng以上
微量 抽出済みRNA(total RNA) 100ng以下
ｍRNA精製済みあるいはｒRNA除去済みのRNA(20ng以上）
調整済みライブラリー（DNBSEQの場合は、受け入れが難しい場合があります）
シーケンスデータ
Other:
RNA-seqで必要な作業
Directional(Strand情報を得る）
rRNA除去(分解の進んだRNAや細菌RNAなどでは必要になります）
ｍRNAの精製（標準で実施しますが、キットの希望があれば教えてください。）
相談の上で決めたい
Other:
DNase処理について
*
DNase処理済である（DNase処理不要）
DNase処理を実施して欲しい(追加費用が必要になります）
あいのりでのシーケンスについて（1レーン90-120Gbpです）
必要なデータ量が少ない場合は、あいのりでのシーケンスで構わない。
できれば、あいのりでのシーケンスを避けたい（データ量によってはコスト高となります）
相談の上で決めたい（それぞれの見積もりを希望）
Clear selection
必要な作業について、ご希望（キットや手法）などあればご記入ください。
Your answer
データ解析の実施
*
必要なし（Fastq納品)
データ解析の必要あり
必要なデータ解析（必要な方）
相談の上で決めたい
シーケンスデータの処理・フィルタリング
マッピングおよびリードのカウント
発現比較解析（2群解析）
クラスタリング解析
ヒートマップ解析
GO解析
パスウェイ解析
GSEA解析
De novo RNA-seq
Other:
2群比較を行う場合、その組み合わせの数を教えてください。
Your answer
利用できるリファレンスゲノムはありますか？(データ解析まで実施する場合）
ある（アノテーションまで付与されている必要があります）
あるが、対象生物と距離がある可能性がある
ない
ないが、この際、全ゲノムを決定してからRNAseqを実施したい（細菌等）
分からない・調べてほしい
Other:
Clear selection
データ解析について（目的やご要望など）
Your answer
参考論文があればご記入ください。
Your answer
検体のご準備できる時期とご希望の納期を教えてください。
ご依頼の有無に関係なく、ご予定を教えてください。ご希望の納期によりシーケンス費用が変わりますので（特に最短納期を希望の場合）、ご希望をお教え下さい。
検体の発送の予定・時期の目安（お見積りだけの方も大まかな時期を教えてください）
1-2週間以内
1ヶ月以内
2-3ヶ月以内
3-6か月以内
検体が集まり次第
Other:
Clear selection
希望納期（Fastq取得までの時間です。データ解析は＋２－４週間のお時間がかかります。ご依頼の有無に限らずご希望を教えてください。短納期の方は高くなってしまいます。）あいのりの都合で、NovaSeq6000の場合は納期がかかる可能性があります。
最短を希望（2週間程度）
お急ぎ・納期指定あり
標準納期（2~3か月程度）
標準納期 優先プランを希望（1検体＋2000円＋税）
Other:
Clear selection
シーケンス費用をさらに抑えたい場合（Valueプラン）
*
既定の濃度にRNAを調整して送ることができる。Qubit測定で30-50 ng/ul
RNAが大きく分解されていないことを事前に確認している。
RIN値を事前に測定しており、新たなRIN値の測定は不要である。
NanodropでOD値を測定している。
Required
解析後の残余サンプルの扱い
返却して欲しい（着払い伝票を同封していただける場合は無料で返却）
返却して欲しい（返却費用1700円＋税）
データに問題がなければ、一定期間後に廃棄して欲しい
Clear selection
ご利用の代理店（もし代理店様を通じてのお取引を希望される場合はご記入ください）
Your answer
どちらで本サービスをお知りになりましたか？
代理店の方からの御紹介
他の研究者の方からの御紹介
ホームページ
雑誌広告
学会ブース
ツイッター
リピート
Other:
その他、連絡事項等がございましたらご記入下さい。
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