Контрольная работа: NGS, сборка (2020)
(вопросы по лекциям о методах секвенирования и сборке de-novo)
Email *
E-mail, еще раз: *
Фамилия И.О. *
Группа *
Для какой технологии секвенирования характерны ошибки гомополимерного сдвига? *
2 points
Required
Наиболее дешевой в расчете на 1 нуклеотид платформой является *
1 point
Запишите последовательность нуклеотидов цепи ДНК, которая получается в результате секвенирования по Сэнгеру согласно гелю, приведенному на слайде №11 (http://intbio.org/bioinf2020-2021/NGS_1.pdf) *
Используйте для записи только буквы латинского алфавита в верхнем регистре: A, G, T, C. Запишите последовательность растущей цепи ДНК, то есть той, которая физически отвечает самому длинному фрагменту в геле, но без учета последовательности праймера (которую мы, конечно же, не увидим)
2 points
ДНК-полимераза не используется в следующих технологиях секвенирования *
2 points
Required
Для сборки крупного генома de-novo оптимально будет выбрать следующую технологию секвенирования: *
Нужно выбрать наиболее оптимальную технологию, учитывая все факторы
1 point
 Для определения однонуклеотидных замен (SNP) данного индивидуума относительно имеющегося референсного генома с высокой точностью лучше использовать следующие технологии секвенирования: *
Выберите 2 наиболее подходящих варианта
2 points
Required
Сборщик на основе графов де-Брёйна использует *
1 point
Представьте, что вы собрали новый геном программой-сборщиком Velvet из данных Illumina HiSeq 2500 и получили черновую сборку низкого качества. Выберите оптимальную стратегию улучшения сборки из ниже перечисленных: *
1 point
Выберите верное утверждение: "увеличение длины рида (прочтения) ... " *
2 points
Выберите верные утверждения: "увеличение покрытия генома (общего числа ридов, данных программе-сборщику) ... " *
2 points
Required
Сборка генома содержит набор контигов следующих длин [5, 10, 15, 20, 30]. Чему равна N50-статистика данной сборки? *
2 points
Есть ли Эйлеров и Гамильтонов обходы у графа, изображенного на рисунке? *
1 point
Captionless Image
Ошибки секвенирования больше мешают сборщикам, основанным на *
1 point
В графе де-Брёйна насчитали ровно 128 ребер. Сколько вершин у такого графа? *
0 points
Дайте определение понятия "контиг" *
Опишите технические причины, которые не позволяют платформе Illumina секвенировать молекулы большой длины *
При сборке DBG-сборщиком вы можете варьировать параметр длины k-мера. К чему приведет выбор большего значения k? *
0 points
A copy of your responses will be emailed to the address you provided.
Submit
Clear form
Never submit passwords through Google Forms.
reCAPTCHA
PrivacyTerms
This content is neither created nor endorsed by Google. Report Abuse - Terms of Service - Privacy Policy
Google Forms